В Институте Фтизиопульмонологии «Кирилл Драганюк» действуют 6 клинических отделений на 315 коек, 8 параклинических отделений и лаборатории оснащенными современным медицинским оборудованием: Консультативное отделение, Отделение Фтизиологии I, Отделение Фтизиологии II, Отделение Фтизиопульмонологии, Отделение Многоустойчивого Туберкулеза 1 и2, Структура управления качествa медицинских услуг, Отделение Анестезиологии и Реаниматологии, Служба Физической медицины, Отделение Функциональной Диагностики, эндоскопии и ЛОР-заболеваний, Отделение Рентгенологии, Лаборатория Медицинской Диагностически, Национальная Референс Лаборатория, Отделение Патологической анатомии, Координационный отдел НПOТ, Фармация.